Sebagai instansi pendidikan Fakultas Kedokteran UMS selayaknya memiliki pedoman dalam menjalankan aktivitas akademiknya. Rencana Strategis (RENSTRA), Rencana Pengembangan Jangka Panjang (RPJP) dan Rencana Induk Pengabdian dan Penelitiaan (RIP) dihadirkan sebagai pedoman.